Na trajetória da Fundação, as ações de prevenção, monitoramento, fiscalização e combate direto, tiveram prioridade sobre as unidades de conservação que são áreas de relevante interesse ecológico. Além disso, o esforço foi dirigido à defesa do ambiente focado no Pantanal.
Como fruto de todos seus esforços, a Fundação conseguiu diversos reconhecimentos, tanto nacionais como internacionais, tais como:
Reconhecimento como Organização da Sociedade Civil de Interesse Público.
Certificado de Homenagem atribuído pela Polícia Militar do Estado de Mato Grosso.
Prêmio Ambiental Von Martius – Categoria Natureza.
Prêmio UNESCO: Prêmio concedido pela Organização das Nações Unidas para Educação, Ciência e Cultura.
Reserva da Biosfera: O Programa “O Homem e a Biosfera” foi criado pela UNESCO.
Sítio do Patrimônio Natural Mundial: O reconhecimento do complexo de áreas protegidas do Pantanal.
Prêmio Mundial de Meio Ambiente: Concedido pela WANGO.
Rede Mundial "Lagos Vivos" (Living Lakes): Através de suas ações no Pantanal Mato-Grossense.